En el año 2000,  la organización había conseguido la certificación ISO 9001:1994 del sistema de gestión de calidad para diseño, construcción, operación y mantenimiento de sistemas de transporte de gas natural y, en 2001, a raíz de la primera auditoría de seguimiento, la certificación ISO 9001 versión 2000 con el mismo alcance, la cual mantuvo hasta 2006 cuando se amplió el alcance al servicio de distribución de gas natural. 

Alcanzar estas certificaciones ratifica el compromiso de Promigas con la excelencia y garantiza a sus accionistas, clientes, proveedores y la comunidad la calidad de sus servicios.